%A 张磊,晁江涛,崔萌萌,陈雅琼,宗鹏,孙玉合 %T 茄子microRNAs与其靶基因的生物信息学预测 %0 Journal Article %D 2011 %J 遗传 %R 10.3724/SP.J.1005.2011.00776 %P 776-784 %V 33 %N 7 %U {http://www.chinagene.cn/CN/abstract/article_2321.shtml} %8 2011-07-20 %X microRNAs(miRNAs)是一类在真核生物中发现的长度为21 nt左右、非编码、内源性的单链小分子RNA, 通过与靶基因的互补发挥转录后水平的负调控作用。目前, 已在许多物种中报道了miRNAs的存在, 然而还未见关于茄子miRNAs的报道。根据miRNAs在植物中的高度保守性及其前体的二级结构特征, 文章通过同源预测的方法, 将已知植物的miRNAs与茄子EST数据库比对, 经过一系列的筛选, 最终预测到12个家族的16条茄子miRNAs, 其中包括3个miRNA家族的正义/反义miRNAs, 而miR390和miR399家族的正义/反义miRNAs属于第一次发现。文章还通过在线软件psRNATarget预测到15条茄子miRNAs的71个靶基因, 这些靶基因主要编码与茄子生长发育、新陈代谢以及胁迫响应等过程相关的蛋白。