%A 谷光明,王进科 %T 哺乳动物转录因子DNA结合谱 %0 Journal Article %D 2012 %J 遗传 %R 10.3724/SP.J.1005.2012.00950 %P 950-968 %V 34 %N 8 %U {http://www.chinagene.cn/CN/abstract/article_2537.shtml} %8 2012-08-20 %X 基因差异表达是生物发育和对刺激作出应答的分子基础, 转录因子在这种基因差异表达中发挥着重要的调控作用。因此, 要弄清楚转录因子调控基因差异表达的机理, 就必须鉴定出它们全部的靶基因并构建其操纵的转录调控网络。对基因组DNA的序列特异性结合是转录因子调控基因转录的关键环节, 因此, 要鉴定转录因子的靶基因, 就必须从它们与DNA相互作用的分子水平, 鉴定它们能够识别并结合的全部DNA序列, 即转录因子DNA结合谱。近年来随着DNA微阵列芯片和高通量DNA测序技术的产生和快速发展, 出现了建立转录因子体内及体外DNA结合谱的一系列革命性的新技术, 对该领域的研究带来重大影响。这些新技术主要包括建立转录因子体内DNA结合谱的染色质免疫沉淀-芯片技术(ChIP-chip)和染色质免疫沉淀-测序技术(ChIP-Seq), 以及建立转录因子体外DNA结合谱的双链DNA微阵列芯片技术(dsDNA microarray)、指数富集配体系统进化-系列分析基因表达技术(SELEX-SAGE)、结合-n-测序技术(Bind-n-Seq)、多重大规模并行SELEX技术(MMP-SELEX)、凝胶迁移实验-测序技术(EMSA-Seq)和高通量测序-荧光配体互作图谱分析技术(HiTS-FLIP)。文章将对这些新技术做一综述。