%A 杨超,汪青雄,黄原,肖红 %T 棕头鸥线粒体基因组全序列测定与分析 %0 Journal Article %D 2012 %J 遗传 %R 10.3724/SP.J.1005.2012.01434 %P 1434-1446 %V 34 %N 11 %U {http://www.chinagene.cn/CN/abstract/article_2589.shtml} %8 2012-11-20 %X 基于长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了棕头鸥(Larus brunnicephalus)的线粒体基因组全序列。结果表明, 棕头鸥线粒体基因组全长16 769 bp, GenBank登录号 JX155863。基因含量和排列次序与红原鸡一致, 包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和一个D-loop区(控制区)。除COI基因以GTG、ND3基因以ATT为起始密码子外, 其余11个蛋白质编码基因均以ATG起始。11个蛋白质编码基因以典型的完全终止密码子AGG、TAG、TAA或AGA终止, COIIIND4基因为不完全终止密码子T。预测了22个tRNA基因的二级结构, 发现tRNASer ( AGN ) 缺少DHU臂, tRNAPhe的TψC臂出现第4种排列形式。预测的棕头鸥12S和16S rRNA二级结构分别包括4个结构域47个茎环和6个结构域60个茎环。其他鸟类控制区发现的F-box、E-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB-boxes (1-3)也存在于棕头鸥中, 预测了控制区H链复制起始序列OH和双向复制起始序列LSP/HSP。系统发育分析支持将棕头鸥划归为面具鸥族(Masked gulls)。