%A 孙广鑫, 栾雨时, 崔娟娟 %T 番茄中与致病密切相关miRNA的挖掘及特性分析 %0 Journal Article %D 2014 %J 遗传 %R 10.3724/SP.J.1005.2014.00069 %P 69-76 %V 36 %N 1 %U {http://www.chinagene.cn/CN/abstract/article_2789.shtml} %8 2014-01-20 %X

MicroRNAs(miRNAs)是一类在真核生物体内普遍存在的、长度约22nt的内源性非编码小分子RNA, 它通过与靶mRNA的结合参与多种基因的表达调控。番茄作为一种重要的模式植物, 其miRNA的研究近年来也取得了较大的进展。文章通过搜集已报道的文献和miRBase, 找到番茄中34个miRNA的表达与致病相关, 采用生物信息学方法预测它们的靶基因, 利用Cytoscope软件构建miRNA及其靶基因的调控网络。从中筛选出13个与致病密切相关的miRNA, 根据各miRNA之间关联性的大小及其与致病相关靶基因的多少, 进一步选出miR169、miR482、miR5300、miR6024、miR6026和miR6027, 并对其进行了靶基因功能分析、启动子分析及实时定量PCR验证, 为全面深入研究miRNA的作用机制奠定了基础。