%A 邹文超, 沈林林, 沈建国, 蔡伟, 詹家绥, 高芳銮 %T 马铃薯Y病毒多基因系统发育分析及其在株系鉴定中的应用 %0 Journal Article %D 2017 %J 遗传 %R 10.16288/j.yczz.17-206 %P 918-929 %V 39 %N 10 %U {http://www.chinagene.cn/CN/abstract/article_5204.shtml} %8 2017-10-20 %X

为实现马铃薯Y病毒(Potato virus Y, PVY)常见株系的快速鉴定,本文以PVY的P1HC-proVPgCP 4个基因为研究对象建立了快速准确的多基因联合体系。根据基因的不同组合建立5个不同数据集,分别进行系统发育分析,并通过贝叶斯标签关联显著性(Bayesian tip-association significance, BaTS)分析各数据集中代表分离物与株系的关联性,以确定实现PVY快速鉴定的最佳组合。不同数据集的系统发育及BaTS分析结果显示,除了联合P1VPgCP 3个基因数据集外,其他4个数据集均无法实现PVY常见株系的准确鉴定。采用不同建树方法对联合P1VPgCP 3个基因数据集比较分析显示,基于ML法和NJ法的系统发育树在拓扑结构上基本一致,均优于基于贝叶斯算法的最大分支置信(maximum clade credibility, MCC)树。同时,以HLJ26分离物为研究对象,对建立的多基因联合体系进行实际应用,结果显示该分离物与PVYNTN-NW株系的3个分离物SYR-Ⅱ-2-8、SYR-Ⅱ-Be1和SYR-Ⅱ-DrH以高置信值聚为一亚簇,表明该分离物可能属于PVYNTN-NW株系(SYR-Ⅱ型)。重组分析显示,HLJ26基因组存在4个潜在的重组信号,分别位于P1、HC-pro/P3、VPg和CP的5°-末端,与PVYNTN-NW株系(SYR-Ⅱ型)的重组位点相一致,表明其属于PVYNTN-NW株系(SYR-Ⅱ型)。同时,应用多重RT-PCR成功扩增出约为1000 bp和400 bp的2个特异性片段,与PVYNTN-NW株系(SYR-Ⅱ型)的特异条带大小相一致。这些结果进一步支持了多基因联合体系的鉴定结果。联合P1VPgCP 3个基因数据集系统发育分析,可以实现PVY常见株系的准确鉴定。