%A 杜坤, 毛初阳, 任安勇, 吴雪梅, 李庆玲, 陈婷婷, 陈仕毅, 赖松家 %T 家兔前体脂肪细胞分化不同时期基因表达谱分析 %0 Journal Article %D 2020 %J 遗传 %R 10.16288/j.yczz.19-265 %P 309-320 %V 42 %N 3 %U {http://www.chinagene.cn/CN/abstract/article_5480.shtml} %8 2020-03-20 %X

脂肪的过度积累严重危害人类健康。前体脂肪细胞分化是脂肪发育的关键过程,研究前体脂肪细胞分化相关基因的表达有助于认识脂肪沉积的机理。尽管家兔是一种理想的研究脂肪发育的动物模型,但是针对其前体脂肪细胞分化不同时期基因表达谱的研究鲜见报道。本研究通过诱导家兔前体脂肪细胞分化,在分化第0 d、3 d和9 d收集脂肪细胞,利用转录组测序(RNA-seq),在分化第3 d样本与第0 d样本的比较中筛选出1352个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),在分化第9 d样本与第3 d样本的比较中筛选出888个DEGs。GO (gene ontology)功能富集和KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析发现,0~3 d分化期上调的DEGs显著富集在PPAR信号通路和PI3K-Akt信号通路上,3~9 d分化期上调的DEGs显著富集到与细胞周期调控有关的GO条目和KEGG信号通路,0~3 d和3~9 d阶段特异上调的DEGs可能分别作用于细胞质和细胞核。通过DEGs的蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction, PPI)网络分析发现,筛选出的核心节点(hub node)基因可能通过调控细胞周期而影响家兔前体脂肪细胞分化。