BIG-Annotator:基因组测序数据高效功能注释及其在遗传诊断中的应用
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黄莹,刘琪,池连江,石承民,吴祯,胡敏,石宏,陈华
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Application of BIG-Annotator in the genome sequencing data functional annotation and genetic diagnosis
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Huang Ying,Liu Qi,Chi Lianjiang,Shi Chengmin,Wu Zhen,Hu Min,Shi Hong,Chen Hua
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表6 肿瘤组织全基因组测序变异注释报告 |
Table 6 Annotation report of whole-genome-sequencing variants of tumor cells |
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染色体 | 碱基位置 | 突变 | 突变种类 | 影响基因 | 变异类型 | 蛋白变化 | 临床意义 | 相关疾病 | 影响方式 | 靶向药物 | Chr.2 | 79523268 | T→TAG TTAAAA ATAATA TACAAA TTTATA | 杂合 | CTNNA2 | Frame shift Insertion | CTNNA2:NM_001282 598:exon1:c.56_57 insAGTTAAAAATAATA TACAAATTTATA:p.F 19fs | 可能致病 | 胃癌 子宫内膜癌 | 癌症上的 通路 | 无 | Chr.X | 123885987 | G→GAT | 杂合 | XIAP | Frame shift Insertion | XIAP:NM_001167:exo n2:c.325_326insAT:p. G109fs,XIAP:NM_001 204401:exon2:c.325_ 326insAT:p.G109fs | 可能致病 | 小细胞 肺癌 | 癌症上的 通路 | 无 |
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