SNP芯片数据估计动物个体基因组品种构成的方法及应用

何俊,钱长嵩,RichardG.TaitJr.,StewartBauck,吴晓林

Estimating genomic breed composition of individual animals using selected SNPs

He Jun,Qian Changsong,G. Tait Jr. Richard,Bauck Stewart,Wu Xiaolin

表1 5个牛品种使用的芯片信息

Table 1 The information of SNP chips used by five cattle breeds

品种 数量 SNP数 最小等位基因频率 日本红毛和牛 198 49 463 0.250±0.155 安格斯牛 18137 40 660 0.215±0.179 海福特牛 2423 40 663 0.270±0.150 荷斯坦牛 8905 49 463 0.295±0.152 娟珊牛 6911 49 463 0.256±0.158