基于CRISPR/Cas系统的噬菌体基因组编辑

梁彩娇,孟繁梅,艾云灿

CRISPR/Cas systems in genome engineering of bacteriophages

Liang Caijiao,Meng Fanmei,Ai Yuncan

图1 基于CRISPR/Cas系统的噬菌体基因组编辑A：采用Ⅱ-A类CRISPR/Cas系统编辑2972噬菌体基因组。从左到右模板质粒的作用：在原间隔PS91旁侧PAM处引入无义突变(GAA→TAA,红色三角形→黑色三角形)、使非必需基因orf33被删除306 bp长的DNA片段和使orf33被基因LlaDCHIA (紫色)替换。B：采用Ⅲ-A类CRISPR/Cas系统编辑Andhra噬菌体orf9。三角形标示处为编辑点(沉默突变：ATT→ATA,红色三角形→黑色三角形)。C：采用Ⅰ-E类CRISPR/Cas系统编辑T7噬菌体基因1.7。D：采用Ⅰ-E类CRISPR/Cas系统(位于霍乱弧菌E7946基因组上)编辑ICP1_2011_A噬菌体(本身含有Ⅰ-F类CRISPR/Cas系统)基因cas1。S：间隔;PS：原间隔;CR：CRISPR阵列;WT-T7：未发生重组的野生型(Wild type) T7噬菌体;T7Δ1.7：基因1.7被删除的T7噬菌体;csn2为Nmeni亚类cas;csm1-6为Mtube亚类cas;csy1-4为Ypest亚类cas;cse1-2为Ecoli亚类cas。Cas9:RNA、Cascade和Cas10-Csm见表1。图1B参考文献[31,36]修改绘制。

Fig. 1 CRISPR/Cas systems in bacteriophage genome editing