植物环状RNA研究进展
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骆甲,王型力,孙志超,吴迪,张玮,王正加
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Progress in circular RNAs of plants
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Luo Jia,Wang Xingli,Sun Zhichao,Wu Di,Zhang Wei,Wang Zhengjia
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表1 7种植物circRNA鉴定信息 |
Table 1 Identification of circular RNAs in seven plants |
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物种 | 测序组织 | 数据来源 | circRNA数量(外显子circRNA数量) | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 叶片[21] | 数据库编号PRJNA218215 | 6012 (5152) | 叶片[29] | 数据库编号GSE43616 | 168 (158) | 水稻(Oryza sativa) | 水稻根部[21] | 数据库编号PRJNA215013 | 12037 (6074) | 幼穗和成熟叶片[36] | 栽培稻自测 | 2354 (1356) | 根部[37] | 水培稻自测 | 3011 (1846) | 小麦(Triticum aestivum) | 幼苗叶片[30] | 干旱逆境处理自测 | 88 (6) | 大麦(Hordeum vulgare) | 叶片和未成熟的种子[34] | 铁锌溶液喷施叶面处理自测 | 62 (5) | 番茄(Solanum lycopersicum) | 果皮[32] | 冷胁迫处理自测 | 854 (615) | 猕猴桃(Pseudomonas syringae) | 幼叶[33] | 病菌胁迫处理自测 | 3582 (2293) | 大豆(Glycine max) | 根茎叶[38] | 温室种植自测 | 5372 (2494) |
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