靶向miRNA前体不同类型sgRNA的丰度及特异性评估

刘海龙,谌阳,高杨,周玲,韩晓松,赵长志,杨高娟,陈毅龙,杨慧,谢胜松

Assessing abundance and specificity of different types of sgRNA targeting miRNA precursors

Liu Hailong,Shen Yang,Gao Yang,Zhou Ling,Han Xiaosong,Zhao Changzhi,Yang Gaojuan,Chen Yilong,Yang Hui,Xie Shengsong

图2 猪miRNA前体中sgRNA靶点丰度及脱靶效应 A：靶向猪miRNA前体sgRNA打靶或脱靶位点碱基错配示意图;B：预测的脱靶位点不同碱基错配数量分布;C：存在多个完全匹配结合位点的sgRNA频率分布。0M代表完全匹配的靶点,1M代表存在一个碱基错配的脱靶位点,2M代表存在2个碱基错配的脱靶位点,3M代表存在3个碱基错配的脱靶位点,4M代表存在4个碱基错配的脱靶位点,5M代表存在5个碱基错配的脱靶位点。On-target代表打靶位点,Off-target代表脱靶位点。红色竖线代表发生碱基错配。

Fig. 2 The abundance of sgRNA target and its off-target effect in pig miRNA precursors