β-内酰胺酶耐药基因blaOKP进化及其侧翼序列特征研究
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邓雯文,龙梅,杨盛智,邹立扣
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Evolution and the flanking sequences of β-lactamase resistance gene blaOKP
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Deng Wenwen,Long Mei,Yang Shengzhi,Zou Likou
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| 表1 不同blaSHV、blaOKP和blaTEM基因基本信息 |
| Table 1 Basic information of different blaSHV, blaOKP, and blaTEM genes |
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| 基因型/亚型 | 种属 | 菌株/质粒名称 | GenBank号 | 定位 | 提交时间 | 国家/地区 | | blaSHV-1 | 鼠疫耶尔森氏菌
(Yersinia pestis biovar Orientalis str.) | plasmid pIP1202 | CP000603.1 | 质粒 | 2007 | 美国 | | blaSHV-5 | 斯氏普罗威登斯菌(Providencia stuartii) | plasmid pTC2 | JQ824049.1 | 质粒 | 2012 | 法国 | | blaSHV-12 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | plasmid pYD626E | KJ933392.1 | 质粒 | 2014 | 美国 | | blaSHV-12 | 阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae) | plasmid pEC-IMP | NC_012555.1 | 质粒 | 2008 | 中国台湾 | | blaSHV-12 | 肺炎克雷伯氏菌
(K. pneumoniae subsp. pneumoniae) | plasmid pKP1034 | KP893385.1 | 质粒 | 2015 | 中国大陆 | | blaSHV-12 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae KPS77) | plasmid pKPS77 | NC_023330.1 | 质粒 | 2013 | 法国 | | blaSHV-11 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | plasmid pKPC-LK30 | KC405622.1 | 质粒 | 2012 | 中国台湾 | | blaSHV-11 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae 7433) | plasmid pTR2 | KJ187752.1 | 质粒 | 2014 | 中国台湾 | | blaSHV-11 | 肺炎克雷伯氏菌
(K. pneumoniae subsp. pneumoniae) | NTUH-K2044 DNA | AP006725.1 | 基因组 | 2004 | 中国大陆 | | blaOKP-B-13 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | plasmid kp622 | AY825330.1 | 质粒 | 2004 | 中国大陆 | | blaOKP-B-14 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | 未命名 | DQ149136.1 | 基因组 | 2005 | 加拿大 | | blaOKP-B-5b | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | 未命名 | DQ149138.1 | 基因组 | 2005 | 加拿大 | | blaOKP-A-13 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | clone S1L | FJ534513.1 | 基因组 | 2008 | 中国大陆 | | blaOKP-A-14 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | clone S1L | FJ534512.1 | 基因组 | 2008 | 中国大陆 | | blaOKP-A-15 | 肺炎克雷伯氏菌(K. pneumoniae) | clone S1L | FJ755841.1 | 基因组 | 2008 | 中国大陆 | | blaTEM | 大肠杆菌(E. coli 22C) | 未命名 | GQ983315.1 | 质粒 | 2009 | 葡萄牙 | | blaTEM | 阴沟肠杆菌(E. cloacae 68Q) | 未命名 | GQ983341.1 | 质粒 | 2009 | 葡萄牙 | | blaTEM | 肺炎克雷伯氏菌
(K. pneumoniae subsp. pneumoniae) | CLSiS 3151/98 pbla-TEM-68 | NG_050281.1 | 基因组 | 2016 | 波兰 |
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