RNA干扰猪NHEJ通路修复因子对HR效率的影响

全绒,李国玲,莫健新,钟翠丽,李紫聪,顾婷,郑恩琴,刘德武,蔡更元,吴珍芳,张献伟

Effects of RNA interference on the porcine NHEJ pathway repair factors on HR efficiency

Quan Rong,Li Guoling,Mo Jianxin,Zhong Cuili,Li Zicong,Gu Ting,Zheng Enqin,Liu Dewu,Cai Gengyuan,Wu Zhenfang,Zhang Xianwei

图4 RNAi对HDR效率的影响 A和E：分别代表以双链DNA模板和ssODN模板的HDR修复模式图。有DSB的缺陷GFP质粒与另一个没有启动子的供体质粒(A)或左右各45nt,共90nt的ssODN (E)发生同源重组修复,GFP表达框修复完整,细胞可以检测到绿色荧光信号,而没有发生同源重组的质粒则没有荧光表达;蓝色箭头表示引物设计位置。B和F：分别为以双链DNA模板和ssODN模板修复前后的GFP表达框测序结果。红色框为同源重组5°端部分序列。C和G分别为以双链DNA模板和ssODN模板的流式细胞术检测的荧光信号统计结果(n=3)。*表示P<0.05。D和H：为对应流式细胞术检测细胞荧光信号图。对照组1为转染NC siRNA后转染HDR GFP system或ssODN GFP system组;对照组2为转染NC siRNA后仅转染pCD3.1-deficient GFP质粒组;空白组为不转染组。

Fig. 4 Effects of RNAi on HDR-mediated repair efficiency