从遗传力到肠菌力:概念及研究进展
文超良,孙从佼,杨宁

The concepts and research progress: from heritability to microbiability
Wen Chaoliang,Sun Congjiao,Yang Ning
表1 人类肠道mGWAS相关研究
Table 1 Genome-wide association studies of gut microbiota in humans
参考文献* 测序方式 样本数量 主要发现
Blekhman等[9] 宏基因组 93 LCT基因区域与Bifidobacterium的关联
Davenport等[100] 16S rRNA 91+93 8个显著位点:PLD1基因区域与Akkermansiade的关联;嗅觉受体活性与Anaerostipes, BifidobacteriumFaecalibacterium的关联;rs3747113与Lactococcus的关联
Goodrich等[84] 16S rRNA 1126对双胞胎 3个与β多样性显著关联的位点:UHRF2基因区域与加权UniFrac距离的关联;4q22.3区域的2个连锁SNP与Bray-Curtis相异度的关联;
28个与菌群显著关联的位点:SLIT3基因区域与Clostridiaceae的关联;ALDH1A1基因区域和SHA-98的关联;LCT基因区域与Bifidobacterium的关联;CD36基因区域与Blautia的关联等
Bonder等[97] 宏基因组 984+530
(两阶段)
9个与菌群显著关联的稳点:LCT基因区域与Bifidobacterium的关联;LINGO2基因区域与Blautia的关联;lncRNA: RP11-436D23.1与Methanobacteriaceae的关联;2q37.3 和 10p12.1区域与Dialister invisus的关联;VANGL1基因区域与Sutterellacea的关联;
免疫受体(CLEC4F-CD207CLEC4K-FAM90A1NOD1NOD2)和能量代谢(SORCS2SLIT3ARAP1)等相关基因区域共计42个位点与微生物结构和功能的关联
Turpin等[82] 16S rRNA 1098+463(两阶段) UBR3基因区域与Rikenellaceae的关联;CNTN6基因区域与Faecalibacterium的关联;DMRTB1基因区域与Lachnospira的关联;SALL3基因区域与Eubacterium的关联
Beaumont等[101] 16S rRNA 1313 FHITELAVL4TDRG1基因区域与肥胖相关OTU的关联
Wang等[98] 16S rRNA 1812+371(两阶段) 42个位点与β多样性的关联;54个位点与菌群丰度的关联
Rothschild等[96] 16S rRNA 1126对双胞胎 LCT基因区域与Bifidobacterium的关联性
Kolde等[99] 宏基因组 298 FUT2LCT基因区域与Bifidobacterium longum的关联性
Aschard等[102] 16S rRNA 182+451(两阶段) NOD2基因区域与RoseburiaFaecalibacterium prausnitzii的关联