基于迁移学习的MHC-I型抗原表位呈递预测

胡伟澎,李佑平,张秀清

MHC-I epitope presentation prediction based on transfer learning

Hu Weipeng,Li Youping,Zhang Xiuqing

图3 在外部质谱数据上进行独立评估 Pluto的平均0.1% PPV要显著高于从头训练模型,MixMHCpred,NetMHCpan4.0-BA和MHCflurry。Pluto的平均0.1%PPV虽然没有显著高于NetMHCpan4.0-EL,但是在每个分型上的表现都要高于NetMHCpan4.0-EL。*代表P<0.05,**代表P<0.005 (paired t-test)。

Fig. 3 Independent evaluation on external mass spectrometry data set