大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析

邓雯文, 李才武, 赵思越, 李仁贵, 何永果, 吴代福, 杨盛智, 黄炎, 张和民, 邹立扣

Whole genome sequencing reveals the distribution of resistance and virulence genes of pathogenic Escherichia coli CCHTP from giant panda

Deng Wenwen, Li Caiwu, Zhao Siyue, Li Rengui, He Yongguo, Wu Daifu, Yang Shengzhi, Huang Yan, Zhang Hemin, Zou Likou

表1 大肠杆菌CCHTP中耐药基因分析结果

Table 1 Basic information of antibiotic resistance genes in E. coli CCHTP

耐抗生素大类 耐药基因 基因数量 外排泵 macB、adeL、patA、evgS、mdtF、 patB、sav1866和TaeA等 115 糖肽类 vanTG、vanTC、vanRI、vanRF、vanRE、 vanRB、vanHD、vanG、baeS和baeR 12 多肽类 pmrF、pmrE、pmrC、mcr-3、 basS、arnA和arlS 9 四环素类 tetT、tetB(60)、tetA(48)和tet34 7 喹诺酮类 gyrB、gyrA和mfd 4 抗结核药 ndh、katG和kasA 3 磺胺类 sul3和leuO 2 β-内酰胺类 mecC和blaCMY-63 2 多磷类 glpT和murA 2 大环内酯类 chrB 1 环脂肽类 cls 1 肽类抗生素 bacA 1 林可酰胺类 clbB 1 利福霉素类 rphB 1