代谢组学在家养动物遗传育种中的应用
周萌,景军红,毛瑞涵,郭静,王志鹏

Applications of metabonomics in animal genetics and breeding
Zhou Meng,Jing Junhong,Mao Ruihan,Guo Jing,Wang Zhipeng
表1 代谢组学包含物质及研究策略的分类特点
Table 1 The classification of metabolomics
分类类别 种类 特点
理化属性 氨基酸类 主要包括参与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,丙氨酸和天门冬氨酸代谢,谷氨酸代谢,组氨酸代谢,赖氨酸代谢,苯丙氨酸和酪氨酸代谢,色氨酸代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸代谢,半胱氨酸、蛋氨酸、牛磺酸代谢,精氨酸类和脯氨酸类代谢,以及尿素循环等代谢过程的小分子
肽类 主要包括参与二肽和γ-谷氨酰等相关代谢过程的小分子
碳水化合物类 主要包括参与果糖、甘露糖、半乳糖、淀粉和蔗糖、核苷酸糖、戊糖等物质代谢,以及糖酵解、糖异生和丙酮酸代谢过程的小分子
能量类 主要包括参与三羧酸循环和氧化磷酸化等相关代谢过程的小分子
脂类 主要包括参与必需脂肪酸、中链脂肪酸、长链脂肪酸、肉碱、胆汁酸、甘油酯、溶血磷脂、单酰甘油、鞘脂类和固醇/甾体等相关代谢过程的小分子
核苷酸 主要包括参与嘌呤或次黄嘌呤或肌苷、嘧啶或胸腺嘧啶、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸等相关代谢过程的小分子
维生素和辅助因子 主要包括参与抗坏血酸盐和醛酸盐、血红蛋白与卟啉、泛酸和辅酶A和生育酚等相关代谢过程的小分子
外源化合物 主要包括外源化学分子、药物等小分子物质
产生来源 内源性代谢分子 直接由机体产生,分为初级代谢分子(磷酸糖、氨基酸、核苷酸、有机酸等)和次级代谢分子(由初级代谢分子产生,如激素、脂类、植物素等)
外源性代谢分子 来源于体外的化学混合物,部分物质参与体内代谢;主要有药物分子、药物代谢分子等
研究策略 靶标代谢组学 从定量角度研究样品中特定代谢分子的生物学意义,是一种“假设驱动”的代谢组学研究
策略[12]
非靶标代谢组学
(或发现代谢组学)
主要检测样品中代谢分子的相对含量。尽可能多的同时测量样本中包含的所有代谢分子,是从定性和半定量角度分析代谢产物的生物学意义