基于转录组数据的网络分析挖掘鼻咽癌与口腔鳞癌的共享功能模块

陈应坚,廖苑君,林帆,孙胜南,赵小蕾,覃继恒,饶绍奇

Shared functional modules for nasopharyngeal and oral squamous cell carcinoma identified by network analysis of transcriptomes

Chen Yingjian,Liao Yuanjun,Lin Fan,Sun Shengnan,Zhao Xiaolei,Qin Jiheng,Rao Shaoqi

表1 各模块的基本特征和拓扑属性

Table 1 Basic characteristics and topological properties of the shared risk modules

模块 初始种子基因个数 节点数 边数 网络直径 特征路径长度 α值 P值 模块1 18 196 270 7 2.980 2.215 1.000 模块2 16 130 173 8 4.022 2.123 1.000 模块3 16 128 189 7 3.061 2.054 0.817 模块4 10 88 96 9 3.111 2.487 1.000 模块5 9 77 84 7 3.389 2.458 0.999 模块6 7 70 72 6 3.041 2.623 1.000 模块7 6 67 68 5 3.395 2.665 0.927 模块8 7 56 60 7 3.285 2.429 0.997 模块9 6 55 56 7 3.277 2.613 0.999 模块10 8 48 48 8 3.097 2.459 1.000 模块11 6 46 47 7 4.074 2.422 0.981 模块12 4 41 41 6 3.149 2.534 0.990 模块13 5 38 43 9 4.058 2.172 1.000 模块14 3 34 34 4 2.929 2.555 0.961 模块15 9 34 34 9 4.447 2.222 1.000