基于转录组数据的网络分析挖掘鼻咽癌与口腔鳞癌的共享功能模块

陈应坚,廖苑君,林帆,孙胜南,赵小蕾,覃继恒,饶绍奇

Shared functional modules for nasopharyngeal and oral squamous cell carcinoma identified by network analysis of transcriptomes

Chen Yingjian,Liao Yuanjun,Lin Fan,Sun Shengnan,Zhao Xiaolei,Qin Jiheng,Rao Shaoqi

表2 各个模块的核心基因

Table 2 Hub genes of each module

模块 初始种子基因个数 核心基因个数 核心基因 模块1 18 6 PCNA*、FEN1、CDK1*、CCNA2*、CCNB1*和TOP2A* 模块2 16 10 PSMA1、MCM6*、DBF4、MCM10、MCM2*、HOXA1*、 TAP1*、RAD54B、WDYHV1和RIBC2 模块3 16 8 MMP1*、SPARC*、FN1*、COL1A2*、NID1、COL4A1*、COL1A1*和COL3A1* 模块4 10 3 CCL5*、STAT1*和MDK* 模块5 9 4 PRKDC*、CASP6*、MELK和GZMB* 模块6 7 3 SUMO1*、TOPBP1和PHB2 模块7 6 5 ITGAV*、LGALS1*、SPP1*、CD14*和VCAM1* 模块8 7 4 BUB1B*、NDC80、AURKA*和MAD2L1* 模块9 6 3 COPS5、RRAD*和NME1 模块10 8 1 KPNA2* 模块11 6 2 RACGAP1和INHBA 模块12 4 3 PLAT、SERPING1和CEP55 模块13 5 2 CBX3和CBX1 模块14 3 2 HSP90AB1和GMNN 模块15 9 2 NGFRAP1和CENPF*