基于转录组数据的网络分析挖掘鼻咽癌与口腔鳞癌的共享功能模块
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陈应坚,廖苑君,林帆,孙胜南,赵小蕾,覃继恒,饶绍奇
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Shared functional modules for nasopharyngeal and oral squamous cell carcinoma identified by network analysis of transcriptomes
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Chen Yingjian,Liao Yuanjun,Lin Fan,Sun Shengnan,Zhao Xiaolei,Qin Jiheng,Rao Shaoqi
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| 表3 各个模块的KEGG通路分析结果 |
| Table 3 KEGG pathways of each module |
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| 模块 | KEGG通路 | FDR(<0.001) | 模块 | KEGG通路 | FDR (<0.001) | | M1 | hsa04110:细胞周期 | 3.16E-23 | M4 | hsa04060:细胞因子—细胞因子受体相互作用 | 6.23E-14 | | hsa03430:错配修复 | 5.75E-22 | hsa04062:趋化因子信号通路 | 4.03E-12 | | hsa03410:碱基切除修复 | 2.44E-11 | hsa04630:Jak-STAT信号通路 | 4.08E-09 | | hsa03030:DNA复制 | 9.30E-11 | hsa05162:麻疹 | 2.77E-07 | | hsa03420:核苷酸切除修复 | 2.12E-10 | hsa04380:破骨细胞分化 | 3.13E-06 | | hsa04115:p53信号通路 | 4.32E-08 | hsa05168:单纯疱疹感染 | 1.45E-05 | | hsa05200:癌症相关通路 | 7.12E-07 | hsa05203:病毒致癌 | 5.65E-05 | | hsa05222:小细胞肺癌 | 1.28E-05 | hsa05160:丙型肝炎 | 4.91E-04 | | hsa05161:乙型肝炎 | 3.06E-05 | M5 | hsa03450:非同源末端连接 | 3.77E-05 | | hsa05166:HTLV-I感染 | 3.71E-05 | hsa04210:细胞凋亡 | 5.56E-04 | | hsa03460:范可尼贫血通路 | 8.73E-05 | M7 | hsa04810:肌动蛋白细胞骨架调控 | 2.43E-10 | | hsa05215:前列腺癌 | 1.81E-04 | hsa04514:细胞黏附分子 | 2.00E-06 | | hsa05169:EB病毒感染 | 2.48E-04 | hsa04512:ECM受体相互作用 | 5.55E-06 | | M2 | hsa04110:细胞周期 | 2.64E-12 | hsa04510:黏着斑 | 8.62E-06 | | hsa03050:蛋白酶体 | 7.77E-08 | hsa04151:PI3K-Akt信号通路 | 4.04E-05 | | M3 | hsa04512:ECM受体相互作用 | 1.73E-38 | hsa05410:肥厚型心肌病 | 8.97E-04 | | hsa04510:黏着斑 | 5.70E-28 | M8 | hsa04110:细胞周期 | 4.04E-09 | | hsa04151:PI3K-Akt信号通路 | 1.86E-21 | hsa04114:卵母细胞减数分裂 | 3.29E-08 | | hsa04974:蛋白质的消化和吸收 | 5.20E-15 | hsa04914:孕激素介导的卵母细胞成熟 | 1.11E-04 | | hsa05146:阿米巴病 | 2.02E-08 | M11 | hsa04350:TGF-β信号通路 | 1.22E-10 | | hsa05200:癌症相关通路 | 4.34E-06 | hsa04550:调节干细胞多能性信号通路 | 2.00E-05 | | hsa05222:小细胞肺癌 | 4.37E-06 | M12 | hsa04610:补体和凝血级联 | 1.22E-13 | | hsa05205:癌症中的蛋白聚糖 | 9.25E-05 |
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