| circAtlas | http://circatlas.biols.ac.cn | 包括人、猕猴、小鼠、大鼠(Rattus norvegicus)、野猪(Sus scrofa)、红色原鸡(Gallus gallus)中的环状RNA序列信息,查看保守环状RNA,查询环状RNA与miRNA或RBPs的结合情况等功能 | [30] |
| circBase | http://www.circbase.org/ | 包含人、小鼠及秀丽隐杆线虫等所有已鉴定的环状RNA数据 | [82] |
| CIRCpedia | http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia | 人类环状RNA选择性反向剪接和选择性剪接事件 | [72] |
| TSCD | http://gb.whu.edu.cn/TSCD | 储存人、小鼠中组织特异性的环状RNA | [84] |
| Circ2Traits | http://gyanxet-beta.com/circdb/ | 环状RNA与人类疾病的潜在关联,miRNA-circRNA-mRNA- lncRNA (long non-coding RNA)互作网络 | [86] |
| CircInteractome | http://circinteractome.nia.nih.gov | 在人类环状RNA上查询互作蛋白、相关miRNA的结合位点 | [88] |
| CircNet | http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/ | 储存人类组织特异性的环状RNA,circRNA-miRNA-mRNA互作调控网络 | [90] |
| circRNADb | http://reprod.njmu.edu.cn/circrnadb | 储存32 914种人类外显子环状RNA,描述了46种具有编码潜力的环状RNA | [92] |
| CSCD | http://gb.whu.edu.cn/CSCD | 收集了87种人类癌症细胞株,描述了癌症特异性环状RNA | [81] |
| CircR2Disease | http://bioinfo.snnu.edu.cn/CircR2Disease/ | 100种人类环状RNA与661种疾病之间的相关性 | [83] |
| MiOncoCirc | https://nguyenjoshvo.github.io/ | 人类癌症细胞株及肿瘤的环状RNA,描述了可作为癌症诊断或治疗的靶点 | [21] |
| AtCircDB | http://genome.sdau.edu.cn/circRNA | 储存拟南芥中组织特异性的环状RNA,分析circRNA-miRNA互作网络 | [85] |
| PlantCircNet | http://bis.zju.edu.cn/plantcircnet/index.php | 可视化拟南芥、水稻、大麦(Hordeum vulgare L.)等八种模式植物的circRNA-miRNA-mRNA互作网络 | [87] |
| PlantcircBase | http://ibi.zju.edu.cn/plantcircbase/ | 水稻、拟南芥、玉米、番茄及大麦中的环状RNA,预测
circRNA-miRNA-mRNA互作网络,环状RNA结构可视化 | [89] |
| CircFunBase | http://bis.zju.edu.cn/CircFunBase | 收集了超过7000种人、小鼠及植物中的功能性环状RNA,可视化circRNA-miRNA互作网络 | [91] |
| ASmiR | http://forestry.fafu.edu.cn/bioinfor/db/ASmiR | 毛竹(Phyllostachys edulis)、水稻、拟南芥等多种植物中miRNA靶位点和线性RNA之间以及miRNA和环状RNA的选择性剪接之间的相互调控 | [80] |