染色质架构蛋白CTCF调控UGT1基因簇的表达

郑晓飞,黄海燕,吴强

Chromatin architectural protein CTCF regulates gene expression of the UGT1 cluster

Zheng Xiaofei,Huang Haiyan,Wu Qiang

图1 CTCF和cohesin参与人UGT1基因簇的转录调控 A：人UGT1基因簇内CBS分布。人UGT1位于2号染色体,类似于原钙粘蛋白基因簇,由可变区和恒定区组成,可变区内串联排列着9个高度相似的可变区外显子,下游恒定区包含4个恒定区外显子。垂直框代表UGT1基因簇外显子并用不同颜色标记,绿色表示苯酚组可变外显子,橘黄色表示胆红素组可变外显子,红色表示恒定外显子;人肺癌细胞系A549、人肝癌细胞系HepG2、人慢性髓系白血病细胞K562、人胚肾细胞HEK293、正常人表皮角质形成细胞NHEK、人乳腺癌细胞MCF7和人子宫内膜腺癌细胞HEC-1-B的CTCF ChIP-seq数据显示人UGT1基因簇内3个CTCF可结合位点：hCBS1~3,每个CBS方向由下方蓝色三角形指示;B：人UGT1基因簇3个CBS序列及方向性预测;Module#4~1的CBS定义为反向CBS;C：荧光定量PCR技术检测到A549细胞中敲低CTCF后CTCF的转录水平显著降低,shNTC是对照组;;D：蛋白免疫印迹实验证明CTCF蛋白被敲低;E：荧光定量PCR技术检测敲低CTCF对A549细胞中高度表达的UGT1A6、UGT1A7和UGT1A9三个基因的转录的影响;F：荧光定量PCR技术检测A549细胞中敲低SMC3后SMC3的转录水平显著降低;G：蛋白免疫印迹实验证明SMC3蛋白被敲低;H：荧光定量PCR技术检测敲低SMC3对A549细胞中高表达基因UGT1A6、UGT1A7和UGT1A9的转录影响;I：人肺癌细胞系A549、肝癌细胞系HepG2和宫颈癌细胞系HeLa-S3的cohesin蛋白亚基SMC3以及增强子标志p300和H3K27ac在人UGT1基因簇的分布。*：P<0.05 表示有统计学差异,**：P<0.01表示有显著的统计学差异,***：P<0.001 表示有非常显著的统计学差异。

Fig. 1 CTCF and cohesin regulate the transcription of human UGT1 gene cluster