牛SNP芯片分型检出率和分型错误率对基因型填充准确率的影响

李智,何俊,蒋隽,Richard G. Tait Jr.,Stewart Bauck,过伟,吴晓林

Impacts of SNP genotyping call rate and SNP genotyping error rate on imputation accuracy inHolsteincattle

Li Zhi,He Jun,Jiang Jun,G. Tait Jr. Richard,Bauck Stewart,Guo Wei,Wu Xiao-Lin

图4 在两个不同假设前提下SNP分型检出率对基因型填充错误率的影响 蓝色线：SNP分型错误率与SNP分型检出率不相关;橙色线：SNP分型错误率与SNP分型检出率存在负相关关系。

Fig. 4 Impact of SNP genotyping call rate on SNP genotype imputation under two scenarios