CRISPR/Cas9基因编辑在三维基因组研究中的应用 |
刘沛峰, 吴强 |
Probing 3D genome by CRISPR/Cas9 |
Liu Peifeng, Wu Qiang |
图2 CRISPR在三维基因组研究中的技术方法 A:CRISPR介导的DNA片段编辑。通过一对sgRNA介导Cas9在基因组中进行靶向双位点切割,可以造成基因组片段删除、反转、重复或成环等现象,为三维基因组研究提供模型。B:CRISPR介导的基因组位点可视化。通过在sgRNA上加入MS2与PP7等茎环结构,招募融合了荧光蛋白的MCP、PCP等蛋白,将荧光信号特异性地标记在特定的基因组位点。C:CRISPR介导的基因组位点重定位。利用植物激素ABA介导的PYL1与ABI1的相互作用,将PYL1和ABI1分别结合在不同系统的dCas9或其他核体特有的蛋白上,可以将特定的基因组位点定位到新的目标位点。D:以CRISPR为平台的靶向效应系统。将激活或抑制转录以及表观遗传修饰相关蛋白结合在dCas9上,可以特异性地使基因组特定位点的转录水平以及表观遗传学修饰改变。 |
Fig. 2 Application of CRISPR in 3D genomics |
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