基于生物信息学的Hi-C研究现状与发展趋势

吕红强, 郝乐乐, 刘二虎, 吴志芳, 韩九强, 刘源

Current status and future perspectives in bioinformatical analysis of Hi-C data

Lyu Hongqiang, Hao Lele, Liu Erhu, Wu Zhifang, Han Jiuqiang, Liu Yuan

表4 Hi-C数据可视化软件

Table 4 Visual software tools for Hi-C data

方法 交互 网址 WashU Epigenome Browser 浏览器 http://epigenomegateway.wustl.edu/ HiCPlotter Python软件工具 https://github.com/kcakdemir/HiCPlotter 3Disease Browser 浏览器 http://3dgb.cbi.pku.edu.cn/disease/ Juicebox 浏览器,Java软件工具 http://aidenlab.org/juicebox HiC-3Dviewer 浏览器 http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/member/nadhir/HiC3DViewer/ Delta Java软件工具 http://delta.big.ac.cn GITAR Python软件工具 http://genomegitar.org 3D Genome browser 浏览器 http://3dgenome.org Galaxy HiCExplorer 浏览器 https://hicexplorer.usegalaxy.eu