| 科名 | 物种名 | 基因组序列号 | 基因组
大小(Mb) | Contig
N50 (bp) | 特点 | 参考文献 | 潜蝇科
(Agromyzidae) | Liriomyza trifolii | GCA_001014935.1 | 69.70 | 1816 | 班潜蝇性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 食虫虻科
(Asilidae) | Holcocephala fusca | GCA_001015215.1 | 516.23 | 1778 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | Proctacanthus
coquilletti | GCA_001932985.1 | 208.91 | 781,095 | 基因组杂合性为0.47%,重复序列
为15% | [8] | 丽蝇科
(Calliphoridae) | Calliphora vicina | GCA_001017275.1 | 459.23 | 1086 | 红头丽蝇性染色体差异的进化模式
研究 | [7] | | Lucilia sericata | GCA_001014835.1 | 319.94 | 1613 | 丝光绿蝇性染色体差异的进化模式
研究 | [7] | | Phormia regina | GCA_001735545.1 | 549.93 | 5563 | 伏蝇的法医鉴定 | [48] | | Lucilia cuprina | GCA_000699065.2 | 378.27 | 94,823 | 鉴定防治铜绿蝇靶标基因 | [43] | 瘿蚊科
(Cecidomyiidae) | Mayetiola destructor | GCA_000149185.1 | 185.83 | 14,032 | 麦瘿蚊基因组鉴定出426个效应家族基因和2个抵御寄主植物抗性基因 | [45] | 萤蚊科
(Chaoboridae) | Chaoborus trivitattus | GCA_001014815.1 | 269.28 | 2040 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Mochlonyx cinctipes | GCA_001014845.1 | 441.26 | 3304 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 摇蚊科
(Chironomidae) | Belgica antarctica | GCA_000775305.1 | 89.58 | 13,687 | 南极蠓是双翅目昆虫基因组基因数量最少的 | [51] | | Chironomus riparius | GCA_001014505.1 | 154.53 | 7097 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Chironomus tentans | GCA_000786525.1 | 213.46 | 7697 | 鉴定了唾液腺相关基因表达 | [46] | | Clunio marinus | GCA_900005825.1 | 85.49 | 154,800 | 鉴定了蛋白激酶相关基因表达 | [47] | 按蚊科
(Culicidae,
共完成27个
物种基因组测序) | Aedes aegypti | GCA_009613055.1 | 1,278.73 | 11,757,361 | 利用Hi-C技术更新了埃及伊蚊
染色体读长 | [29] | | Aedes albopictus | GCA_006496715.1 | 2,538.37 | 1,184,735 | 利用长片段进行白纹伊蚊基因组
重测序,其N50 > 3 Mbp | [30] | | Culex quinquefasciatus | GCA_000209185.1 | 579.04 | 28,546 | 致倦库蚊嗅觉和味觉受体、唾液腺
基因和杀虫剂解毒作用相关基因家
族数目增加 | [27] | | Anopheles gambiae | GCA_001542645.1 | 250.72 | 101,465 | 鉴定了冈比亚按蚊吸血生理适应性
相关基因表达 | [26] | | Anopheles punctulatus | GCA_000956255.1 | 146.16 | 10,256 | 分析了基因漂流和种群历史演变 | [28] | 突眼蝇科
(Diopsidae) | Sphyracephala
brevicornis | GCA_001015235.1 | 315.52 | 1477 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Teleopsis dalmanni | GCA_002237135.1 | 545.60 | 64,047 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 长足蝇科
(Dolichopodidae) | Condylostylus
patibulatus | GCA_001014875.1 | 451.94 | 1110 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 水蝇科
(Ephydridae) | Cirrula hians | GCA_001015075.1 | 399.69 | 1781 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Ephydra gracilis | GCA_001014675.1 | 410.87 | 2117 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 舌蝇科
(Glossinidae,
共完成6个物种
基因组测序) | Glossinidae
morsitans | GCA_001077435.1 | 363.11 | 49,769 | 鉴定了泌乳特异蛋白和卵胎生
发育过程 | [49] | 蝇科
(Muscidae) | Musca domestica | GCF_000371365.1 | 750.4 | 11,807 | 家蝇基因拷贝数增加,免疫系统
识别和效应基因多样 | [19] | | Stomoxys calcitrans | GCF_001015335.1 | 971.19 | 11,309 | 厩螫蝇基因组主要用于采采蝇
基因组的比较分析 | | | Haematobia irritans | GCA_003123925.1 | 1,143.54 | 5359 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 蚤蝇科
(Phoridae) | Megaselia abdita | GCA_001015175.1 | 412.27 | 3270 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Megaselia scalaris | GCA_000341915.2 | 488.10 | 931 | 蛆症异蚤蝇基因组起初被用作
低覆盖率基因组分析检测 | [50] | 毛蠓科
(Psychodidae) | Clogmia albipunctata | GCA_001014945.1 | 256.25 | 9,372 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Lutzomyia longipalpis | GCA_000265325.1 | 154.23 | 7,481 | 由于难以获取足够高质量长须罗蛉DNA,导致其基因组测序困难 | | | Phlebotomus papatasi | GCA_000262795.1 | 363.77 | 5795 | 由于难以获取足够高质量巴氏白蛉DNA,导致其基因组测序困难 | | 麻蝇科
(Sarcophagidae) | Neobellieria bullata | GCA_001017455.1 | 476.29 | 1894 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | Sarcophagidae sp.
BV-2014 | GCA_001047195.1 | 494.58 | 1035 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 粪蚊科
(Scatopsidae) | Coboldia fuscipes | GCA_001014335.1 | 98.76 | 145,453 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 鼓翅绳科
(Sepsidae) | Themira minor | GCA_001014575.1 | 99.89 | 2825 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 水虻科
(Stratiomyidae) | Hermetia illucens | GCA_009835165.1 | 1,101.33 | 258,950 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 食蚜蝇科
(Syrphidae) | Eristalis dimidiata | GCA_001015145.1 | 315.43 | 405 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 实蝇科
(Tephritidae,
共完成10个
物种基因组测序) | Ceratitis capitata | GCA_000347755.4 | 436.48 | 845,931 | 地中海实蝇基因组鉴定超过1800个与入侵和寄主适应相关mRNA出现基因扩张 | [44] | | Bactrocera oleae | GCA_001188975.4 | 403.08 | 187,710 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Eutreta diana | GCA_001015115.1 | 233.05 | 387 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Tephritis californica | GCA_001017515.1 | 342.26 | 906 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Trupanea jonesi | GCA_001014665.1 | 97.28 | 865 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | | Zeugodacus cucurbitae | GCA_000806345.1 | 374.81 | 17,360 | 瓜实蝇基因组主要用于害虫防治研究 | | 大蚊科
(Tipulidae) | Tipula oleracea | GCA_001017535.1 | 541.7 | 600 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] | 毫蚊科
(Trichoceridae) | Trichoceridae sp.
BV-2014 | GCA_001014425.1 | 41.57 | 1395 | 性染色体差异的进化模式研究 | [7] |
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