74-plex SNPs复合检测体系在中国人群中的族群推断研究
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刘杨, 孙昌春, 马咪, 王玲, 赵雯婷, 马泉, 季安全, 刘京, 李彩霞
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The ancestry inference of Chinese populations using 74-plex SNPs system
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Liu Yang, Sun Changchun, Ma Mi, Wang Ling, Zhao Wenting, Ma Quan, Ji Anquan, Liu Jing, Li Caixia
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表3 测试样本的族群推断结果
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Table 3 The ancestry inference result of test samples
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测试人群(代码) | 来源区域 | 预测第1位的人群(LR>10) | 不排除 (LR≤10) | 错误 | 样本 数量 | 撒哈拉以 南的非洲 | 北非 | 欧洲 | 东亚 | 东北亚 | 东南亚 | 美洲 | 内蒙古达斡尔族(DIC) | EA(东亚) | | | | 19 (0.42) | 8 (0.45) | | | 4 | 3 | 34 | 内蒙古鄂温克族(EIC) | EA(东亚) | | | | 24 (0.56) | 3(0.31) | | | 3 | 5 | 35 | 内蒙古蒙古族(MIC) | EA(东亚) | | | | 59 (0.31) | 37 (0.56) | 2 | | 26 | 13 | 135 | 青海土族(TUQ) | EA(东亚) | | | | 76 (0.26) | 3 (0.63) | | | 20 | 17 | 116 | 青海汉族(CHQ) | EA(东亚) | | | | 74 (0.41) | 3 (0.46) | | | 5 | 18 | 100 | 西藏藏族(CTT) | EA(东亚) | | | | 71 (0.14) | 17 (0.78) | 2 | | 36 | 19 | 143 | 河南汉族(CHN) | EA(东亚) | | | | 87 (0.65) | 1 (0.15) | 2 (0.15) | | 1 | 19 | 107 | 青岛汉族(CHL) | EA(东亚) | | | | 85 (0.61) | (0.28) | 1 | | 0 | 9 | 94 | 广东汉族(CHG) | EA(东亚) | | | | 13 (0.49) | | 13 (0.45) | | 20 | | 46 | 广西汉族(HGC) | EA(东亚) | | | | 13 (0.31) | | 30 (0.60) | | 36 | | 79 | 广东客家汉族(HCM) | EA(东亚) | | | | 17(0.38) | | 15 (0.53) | | 17 | 1 | 50 | 广西侗族(DGC) | SEA(东南亚) | | | | 27 (0.32) | | 65 (0.62) | | 63 | | 155 | 广西京族(KGC) | SEA(东南亚) | | | | 16 (0.21) | | 109 (0.73) | | 58 | 1 | 184 | 云南傣族(CDY) | SEA(东南亚) | | | | 6 (0.18) | | 64 (0.76) | | 23 | | 93 | 非洲尼日利亚人 (ESN) | S-AFR(撒哈拉 以南的非洲) | 99 (0.98) | | | | | | | 0 | | 99 | 芬兰人(FIN) | EUR(欧洲) | | | 99 (0.93) | | | | | 0 | | 99 | 秘鲁人(PEL) | AME(美洲) | | 1 | | | 3 | | 72(0.74) | 3 | 10 | 85 |
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