多组学关联分析揭示表观等位基因在拟南芥环境适应性进化中的作用及机制

梅志超, 位竹君, 于佳慧, 冀凤丹, 解莉楠

Multi-omics association analysis revealed the role and mechanism of epialleles in environmental adaptive evolution of Arabidopsis thaliana

Mei Zhichao, Wei Zhujun, Yu Jiahui, Ji Fengdan, Xie Linan

图1 本研究分析流程 通过eQTLepi (methylation-dependent eQTL)、EWAS (epigenome-wide association study)和转录组-降水量关联分析获得甲基化位点、基因、降水量两两关联的结果,再筛选甲基化位点在基因附近(上游2 kb、内部和下游2 kb)的结果,即获得潜在的表观等位基因,对所有与此甲基化位点关联的基因进行蛋白互作网络(protein-protein interaction, PPI)分析、GO注释富集分析和KEGG通路富集分析,最终获得表观等位基因潜在的作用机制。

Fig. 1 The analysis flowchart of this study