数字PCR技术及其在检测领域的应用
冯秀晶, 易红梅, 任星旭, 任佳丽, 葛建镕, 王凤格

Digital PCR and its application in biological detection
Feng Xiujing, Yi Hongmei, Ren Xingxu, Ren Jiali, Ge Jianrong, Wang Fengge
表1 dPCR仪比较
Table 1 Comparation of commercial dPCR platform
类型 供应商 仪器型号 分散成反应单元数目和体积 通量 进样量
(µL)
通道数 特点
微流控
芯片数
字PCR
美国
Fluidigm
BioMark HD 12 paneL/芯片,765个反应单元/paneL,9180个反应单元/芯片,6 nL /反应单元 12 8 5 全自动微流体控制,可实现12个样品进样和微流体分配,成本高,耗时4 h
BioMarkEP1 48个阵列/芯片,770个腔室/阵列,36,960个反应单元/芯片,0.85 nL/反应单元 48 4 5 全自动微流体控制,可实现48个样品进样和微流体分配,成本高,耗时4 h
美国
ThermoFisher (Life-
technlogies)
QuantStudio3D
数字PCR系统
4个板,20,000个反应孔/芯片,0.72 nL/反应单元 24 16 3 全自动,减少移液过程,基于微加工单晶硅芯片,样本之间完全隔离,全程闭管,防止交叉污染,无“死区”;通量低,每次运行只能分析一个样品 , 耗时4 h
OpenArray/
QuantStudio 12K
48个次级阵列/板,64个反应单元/阵列,共计3072个反应单元/板;33 nL/反应单元 4 100 2 全自动芯片处理,全程闭管防止交叉污染,可同时运行4块3072模块,耗时4 h
微滴数
字PCR
美国Bio-Rad
(QuantaLife)
QX200 ddPCR 微滴生成器8通道设计,可将8个样品分别制备成20,000个液滴,0.837 nL/微滴 1~96 20 2 半自动,常规PCR仪扩增后,利用液滴读取仪读取,操作比较繁琐,配套工具耗材较多,读取耗时较长,防止分散管路堵塞问题
美国Bio-Rad
(RainDance)
Raindrop ddPCR 可将1个样品分割成1000万个微滴,5 pL/微滴 8 25~50 2 原理与QX200类似,设备和芯片耗材成本昂贵,耗时4 h
中国锐讯生物 DropX-2000 20,000~30,000个微滴,
<1 nL/微滴
2~96 20~30 4 人工上样仅需20 s,后续全部自动化,耗时2.5 h
集成微
流微孔
PCR仪
法国 Stilla
Technologies
Naica™ crystal
digital PCR
25,000~30,000个反应单元/芯片,0.43 nL/微滴 12 20 3 集成Sapphire芯片为唯一耗材,人工上样,后续全部自动化,微滴随机平铺成2D阵列,全封闭,无交叉污染,精确到单微滴回溯,耗时2.5 h
中国小海龟 BioDigital 20,000余个液滴/芯片,
0.79 nL/微滴
1~96 30 4 芯片式微滴数字PCR,自动分液时间仅需2 min,微滴随机平铺成,无交叉污染,自动读取数据时间为2 min,全封闭,耗时1.5 h