| HMDB | (1)公开数据库,免费公开下载;
(2)检测定量代谢物18,557个;
(3)包含MS/MS谱图22,247个(2265种化合物)
GC-MS谱图74,189个(2544种化合物);
(4)预测代谢物MS/MS谱图、GC-MS谱图 | MS/MS检测中对前体离子大小有限制
(< 20 Da) | [31] |
| METLIN | (1)公开数据库;
(2)包含超过13,000个标准品的高分辨质谱图;
(3)不同碰撞能量下的高分辨的MS/MS谱图
>68,000个 | (1)所有数据均采自于QTOF质谱;
(2)数据不可以下载 | [32,33] |
| NIST v17 | (1)公开数据库;
(2)包含267,376个化合物的EI 谱图;
(3)包含13,808个化合物的574,826个MS/MS谱图 | 对外部数据来源标识不清 | [34] |
| FiehnLib | (1)包含超过2200个EI谱图,覆盖超过1000种
代谢物 | (1)数据来源于Angilent公司气相色谱-单四级杆质谱和LECO公司GC-TOF;
(2)数据主要来源于植物材料 | [35] |
| LipidSearch | (1)包括超过150万个脂质离子及其预测离子碎片;
(2)包括脂质加合离子和MSn信息 | (1)商业数据库;
(2)数据使用Thermo公司orbitrap类仪器采集;
(3)MS/MS数据由计算机算法得到 | [32] |
| LMSD | (1)包含43,402个脂质结构;
(2)谱图数据可以下载 | (1)在正负电离模式下预测MS/MS谱;
(2)MS/MS光谱仅适用于每种脂质的一种加合物 | [36] |
| MassBank | (1)公开数据库;
(2)支持输入文本格式的质谱搜索;
(3)所有质谱图均是由标准品得到的;
(4)有19,000个MS1和28,000个 MS2及MSn谱图 | (1)数据库中信息未经充分筛选;
(2)某些谱图信息包含噪音信号 | [37,38] |
| KEGG | (1)综合性数据库;
(2)包含代谢通路和互作网络信息;
(3)包含17,268种代谢物和460条通路 | 图片分辨率较低,不美观 | [39] |
| Reactome | (1)公开数据库;
(2)包含1419个化合物及人类2287条通路 | 数据来源较为单一,主要收集人体主要代谢
通路信息 | [40] |
| MetabolomeXchange | (1)公开数据库;
(2)包含的数据来源于4个不同数据库;
(3)包含代谢物结构及参考光谱、生物学作用、组
织和浓度等信息 | 数据库建设完善难度大 | |