代谢组学技术发展及其在农业动植物研究中的应用
田菁, 王宇哲, 闫世雄, 孙帅, 贾俊静, 胡晓湘

Metabolomics technology and its applications in agricultural animal and plant research
Tian Jing, Wang Yuzhe, Yan Shixiong, Sun Shuai, Jia Junjing, Hu Xiaoxiang
表3 代谢组与多组学联合分析在农业动物研究结果汇总
Table 3 Summary of the metabolome combined with multi-omics analysis in agricultural animal study
物种 研究群体 样本类型 研究性状 代谢物分子 研究结论 文献
白杜洛克猪×二花脸猪
(n=591)、苏太猪(n=282)
背最长肌
腹部脂肪
脂肪酸组成 长链脂肪酸 腹部脂肪中C20:0与16号染色体中SNP显著关联;肌肉中C18:0与14号染色体中SNP显著关联;脂肪酸组成的候选基因:SCDELOVL7 [73]
杜洛克猪×长白猪×
约克夏猪DLY(n=610)
背最长肌 酸肉 肌糖原、葡萄糖
(RG)和乳酸
PRKAG3基因中低频错义突变R200Q和PHKG1g.8283C> A引起猪RG含量显著升高,导致DLY猪酸肉性状 [74]
未阉割公猪(n=1282) 颈下脂肪 公猪肉膻味 雄烯酮 SULT2A1、SULT2B1、HSD17B14CYP2A19基因与公猪膻味性状有关 [75]
挪威红牛(n=878) 牛乳 牛乳脂肪酸
组成
短链、中长链和
长链脂肪酸
BTA1、BTA13BTA15中检测到重要的与牛奶脂肪酸相关QTL,鉴定到脂肪酸从头合成重要候选基因NCOA6 [76]
意大利西门塔尔牛(n=416)
意大利荷斯坦牛(n=436)
牛乳 牛乳脂肪酸
组成
脂肪酸 在西门塔尔牛中鉴定到ECI2、PCYT2、DCXR、G6PC3、PYCR1ALG12与牛乳脂肪酸组成相关基因;在荷斯坦牛中CYP17A1、ACO2、PI4K2A、GOT1、GPT、NT5C2、PDE6G、POLR3HCOX15与牛乳脂肪酸组成相关基因 [77]
荷斯坦-弗里斯兰奶牛
(n=248)
牛乳 奶牛酮症预后
研究
磷酸胆碱和
甘油磷酸胆碱
位于25号染色体的APOBR基因中QTL与代谢物显著相关 [78]
荷斯坦牛(n=1217) 血清 血清电解质
QTL鉴定
钙、氯、钠、
钾和镁离子
GATA2、TMEM123SCN5A基因与牛电解质平衡相关 [79]
中国西门塔尔牛(n=723) 最长肌 脂肪酸组成 中链脂肪酸 FASNELOVL5基因组脂肪酸有关 [80]
内洛尔肉牛(表型n=963;
基因型n=1616)
最长肌 脂肪酸含量 中链和长链脂肪酸 鉴定到与脂肪酸相关基因ELOVL5、ESSRG、PCYT1A、ABC5、ABC6ABC10 [81]
日本黑牛(n=574) 最长肌 牛肉鲜味 牛磺酸、肌苷和
次黄嘌呤
鉴定到与牛磺酸相关基因SLC6A6、RAB7A、RPN1CCDC12;与肌苷和次黄嘌呤相关基因NT5E [82]
日本黑牛(n=1836) 最长肌 氨基酸组成 β-丙氨酸和
牛磺酸
鉴定到与氨基酸有关基因STT3B、SUV420H1、CPT1A、MRPL21IGHMBP2 [83]
伊朗Urmia鸡×AA肉鸡
F2群体(n=270)
血浆 代谢性状相关
基因座鉴定
甘油三酯、
胆固醇和葡糖糖
鉴定到与甘油三酯相关基因DOCK10AP1S3 [84]