利用SNP芯片信息评估新疆近交牛基因组纯合度

师睿, 张毅, 王雅春, 黄涛, 卢国昌, 岳涛, 卢振西, 黄锡霞, 卫新璞, 冯书堂, 陈军, 乌兰·卡格德尔, 茹先古丽·阿不力孜, 努尔胡马尔·木合塔尔

The evaluation of genomic homozygosity for Xinjiang inbred population by SNP panels

Shi Rui, Zhang Yi, Wang Yachun, Huang Tao, Lu Guochang, Yue Tao, Lu Zhenxi, Huang Xixia, Wei Xinpu, Feng Shutang, Chen Jun, Kagedeer Wulan, Abulizi Ruxianguli, Muhetaer Nuerhumaer

表2 各群体基因组近交指标

Table 2 Genomic inbreeding indicators for four populations

牛群 HOM% ROH% 平均值 标准差 平均值 标准差 新疆近交牛(XI) 0.681a 0.040 0.136a 0.079 哈萨克牛(塔城,TL) 0.577b 0.006 0.021b 0.013 新疆褐牛(XB) 0.596c 0.025 0.102c 0.060 荷斯坦牛(HO) 0.541d 0.011 0.102c 0.028