利用SNP芯片信息评估新疆近交牛基因组纯合度

师睿, 张毅, 王雅春, 黄涛, 卢国昌, 岳涛, 卢振西, 黄锡霞, 卫新璞, 冯书堂, 陈军, 乌兰·卡格德尔, 茹先古丽·阿不力孜, 努尔胡马尔·木合塔尔

The evaluation of genomic homozygosity for Xinjiang inbred population by SNP panels

Shi Rui, Zhang Yi, Wang Yachun, Huang Tao, Lu Guochang, Yue Tao, Lu Zhenxi, Huang Xixia, Wei Xinpu, Feng Shutang, Chen Jun, Kagedeer Wulan, Abulizi Ruxianguli, Muhetaer Nuerhumaer

图3 各群体中同态相同(IBS)比例以及长纯合片段(ROH)的分布情况 A：不同个体两两之间的同态相同(IBS)关系(浅色表示同态相同程度高,深色则表示程度低);B：不同牛群内个体与剩余群体的IBS平均值分布情况;C：各群体中长纯合片段(ROH)数量与总长度之间的关系,Pop：品种名称缩写;D：各群体中ROH数量和长度的分布情况。XI：新疆近交牛;TL：哈萨克牛(塔城);XB：新疆褐牛;HO：荷斯坦牛。

Fig. 3 Distributions of identity by state (IBS) and runs of homozygosity (ROH) for four populations