利用SNP芯片信息评估新疆近交牛基因组纯合度

师睿, 张毅, 王雅春, 黄涛, 卢国昌, 岳涛, 卢振西, 黄锡霞, 卫新璞, 冯书堂, 陈军, 乌兰·卡格德尔, 茹先古丽·阿不力孜, 努尔胡马尔·木合塔尔

The evaluation of genomic homozygosity for Xinjiang inbred population by SNP panels

Shi Rui, Zhang Yi, Wang Yachun, Huang Tao, Lu Guochang, Yue Tao, Lu Zhenxi, Huang Xixia, Wei Xinpu, Feng Shutang, Chen Jun, Kagedeer Wulan, Abulizi Ruxianguli, Muhetaer Nuerhumaer

图4 各群体长纯合片段(ROH)在常染色体上的分布 A：新疆近交牛不同长度的长纯合片段(ROH)在常染色体的分布情况;B：哈萨克牛(塔城)不同长度的长纯合片段(ROH)在常染色体的分布情况;C：新疆褐牛不同长度的长纯合片段(ROH)在常染色体的分布情况;D：荷斯坦牛不同长度的长纯合片段(ROH)在常染色体的分布情况。红线表示各染色体的ROH%。XI：新疆近交牛;TL：哈萨克牛(塔城);XB：新疆褐牛;HO：荷斯坦牛。

Fig. 4 Chromosomal distributions for runs of homozygosity (ROH) in four populations