水稻典型品种日本晴和IR24根系微生物组的解析

胡雅丽, 戴睿, 刘永鑫, 张婧赢, 胡斌, 储成才, 袁怀波, 白洋

Analysis of rice root bacterial microbiota of Nipponbare and IR24

Hu Yali, Dai Rui, Liu Yongxin, Zhang Jingying, Hu Bin, Chu Chengcai, Yuan Huaibo, Bai Yang

图2 日本晴和IR24的根系微生物组在门/纲级分布上存在差异 柱状图展示每个样品中根系微生物组的物种组成(门和纲水平的相对丰度)。变形菌门(Proteobacteria)因丰度较高在纲水平展开为alpha-、beta-、gamma-和delta-变形菌4个纲,其余为门水平。Acidobacteria：酸杆菌门;Actinobacteria：放线菌门;Bacteroidetes：拟杆菌门;Firmicutes：厚壁菌门;Spirochaetes：螺旋体门。在两个种植地区,IR24根系微生物中的beta-变形菌纲显著高于日本晴,而拟杆菌门和gamma-变形菌纲在日本晴的根系微生物组中丰度更高,此外放线菌门(上庄)和delta-变形菌纲(昌平)只在一个地区在两基因型间有显著差异(Wilcoxon秩和检验,P < 0.05,FDR < 0.2)。CP：昌平;SZ：上庄。每组样品的数量为：IR2_CP (n = 15),日本晴_CP (n = 15),IR24_SZ (n = 17),日本晴_SZ (n = 15)。

Fig. 2 Distinct taxonomic composition of the root microbiota between Nipponbare and IR24