水稻典型品种日本晴和IR24根系微生物组的解析

胡雅丽, 戴睿, 刘永鑫, 张婧赢, 胡斌, 储成才, 袁怀波, 白洋

Analysis of rice root bacterial microbiota of Nipponbare and IR24

Hu Yali, Dai Rui, Liu Yongxin, Zhang Jingying, Hu Bin, Chu Chengcai, Yuan Huaibo, Bai Yang

图3 日本晴和IR24根系的差异OTU及对应门纲水平分类组成 A：在两个种植地点中日本晴根系富集的OTUs。与IR24相比,日本晴在昌平(CP)和上庄(SZ)分别有166个和207个OTU富集,且其中有66个OTU在这两个种植地区都富集(Wilcoxon秩和检验用于比较差异OTUs,当P < 0.05、FDR < 0.2且差异倍数 > 1.2时,认为该OTU在两组样品间存在差异)。B：日本晴在两个种植地区均富集的根系OTUs的分类组成。共同富集的66个OTU大部分属于拟杆菌门,厚壁菌门和gamma-变形菌纲。C：在两个种植地点中IR24根系富集的OTUs。与日本晴相比,IR24在昌平和上庄分别有172个和135个富集OTUs,且其中有45个OTUs在这两个种植地区都富集。D：IR24在两个种植地区均富集的根系OTU的分类组成。共同富集的45个OTU大部分属于beta-变形菌纲,厚壁菌门和delta-变形菌纲。从图中可知,水稻基因型影响了微生物在根系的富集。Actinobacteria：放线菌门;Bacteroidetes：拟杆菌门;Firmicutes：厚壁菌门;Spirochaetes：螺旋体门;其余为alpha-、beta-、delta-、gamma-变形菌纲。

Fig. 3 The overlap and taxonomic composition of OTUs enriched in Nipponbare/IR24 of two fields