水稻典型品种日本晴和IR24根系微生物组的解析

胡雅丽, 戴睿, 刘永鑫, 张婧赢, 胡斌, 储成才, 袁怀波, 白洋

Analysis of rice root bacterial microbiota of Nipponbare and IR24

Hu Yali, Dai Rui, Liu Yongxin, Zhang Jingying, Hu Bin, Chu Chengcai, Yuan Huaibo, Bai Yang

图5 日本晴和IR24的根系菌群形成的共存网络有明显区别 A：日本晴的微生物群落在科水平形成的共存网络。网络中共有52个节点,59条边。B：IR24的微生物群落在科水平形成的共存网络。网络中共有76个节点,93条边。共存网络关系利用Pearson相关系数判断科水平菌间相关性(P < 0.05,|r| > 0.7),网络中每个节点代表一个科,节点大小表示该科在每组样品中的平均相对丰度。其中绿色节点为科水平在两个基因型间存在差异的根系菌(Wilcoxon秩和检验,P < 0.05、FDR < 0.2且差异倍数 > 1.2)。连接节点的边表示该两个节点间的相关性,红色为正相关,蓝色为负相关,线条粗细与相关性高低成正比。C：两个基因型网络间共有菌的连接紧密度比较。两个网络中共有34个菌,统计其中每个菌作为节点与网络中其他菌的关联度(即连接该节点的边的个数)。CP：昌平;SZ：上庄。

Fig. 5 The co-occurrence networks of Nipponbare and IR24 root microbiota have distinct differences