基于序列相似性和Z曲线方法重注释原核生物蛋白编码基因
刘硕, 曾志, 曾凡才, 杜萌泽

Comprehensive re-annotation of protein-coding genes for prokaryotic genomes by Z-curve and similarity-based methods
Liu Shuo, Zeng Zhi, Zeng Fancai, Du Mengze
图4 特定同源簇对应的新基因占全部新基因的比例
A:RNA加工和修饰;B:染色质结构和动力学;Y:核结构;Z:细胞骨架;W:细胞外结构;D:细胞周期控制,细胞分裂,染色体分裂;O:翻译后修饰,蛋白反转,伴侣;Q:次生代谢产物的生物合成、运输和分解代谢;I:脂质转运与代谢;J:翻译,核糖体结构和生物发生;H:辅酶运输与代谢;F:核苷酸转运与代谢;V:防卫机制;N:细胞迁移;C:能量产生和转化;U:细胞内传输,分泌和囊泡转运;P:无机离子转运与代谢;T:信号转导机制;K:转录;E:氨基酸转运和代谢;M:细胞壁和细胞膜的生物发生;G:碳水化合物运输和代谢;S:功能未知;R:只能预测大致功能;L:复制重组和修复。
Fig. 4 The ratio of the newly recognized genes of certain COG to all new genes