RFX5调控原钙粘蛋白α基因簇的表达

王娜, 甲芝莲, 吴强

RFX5 regulates gene expression of the Pcdhα cluster

Wang Na, Jia Zhilian, Wu Qiang

图4 RFX5敲除增加原钙粘蛋白α基因簇增强子与启动子的远距离空间互作 A：RFX5敲除导致增强子与启动子间相互作用增加。在染色质构象捕获QHR-4C实验中,以HS5-1为观测点(viewpoint, VP),显示K30和K56单细胞克隆株中增强子HS5-1与原钙粘蛋白α基因簇启动子之间的染色质相互作用。K30和K56分别与WT相减(K30-WT, K56-WT)发现RFX5敲除后HS5-1与Pcdhα启动子之间的染色质相互作用高于WT克隆。B：RFX5敲除导致启动子与增强子间相互作用增加。以Pcdhα12为观测点的染色质构象捕获实验,显示K30和K56单细胞克隆株中Pcdhα12启动子与增强子HS5-1之间的染色质相互作用。K30和K56分别与WT相减(K30-WT, K56-WT)发现RFX5敲除后Pcdhα12启动子与HS5-1之间的染色质相互作用高于WT克隆。

Fig. 4 RFX5 deletion results in increased long-range chromatin interactions between enhancers and promoters in the Pcdhα gene cluster