DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值

骆红波, 曹鹏博, 周钢桥

Prognostic and predictive value of a DNA methylation-driven transcriptional signature in hepatocellular carcinoma

Luo Hongbo, Cao Pengbo, Zhou Gangqiao

表1 本研究中涉及的所有肝癌队列

Table 1 Samples and datasets used in this study

研究队列 数据集 样本量 数据类型 数据来源 发掘队列 SRP069212 20例配对的癌和癌旁组织 mRNA表达 GEO SRP118972 12例癌组织样本和8例癌旁组织 mRNA表达 GEO GSE89852 33例配对的癌和癌旁组织 DNA甲基化 GEO GSE54503 66例配对的癌和癌旁组织 DNA甲基化 GEO 模型训练队列 TCGA-LIHC 371例癌组织和50例癌旁组织 mRNA表达和DNA甲基化 TCGA ICGC-LIRI-JP 203例癌组织 mRNA表达 ICGC 模型验证队列 GSE76427 115例癌组织 基因表达 GEO GSE84005 37例癌组织 基因表达 GEO