DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值 |
骆红波, 曹鹏博, 周钢桥 |
Prognostic and predictive value of a DNA methylation-driven transcriptional signature in hepatocellular carcinoma |
Luo Hongbo, Cao Pengbo, Zhou Gangqiao |
图1 肝癌中DNA甲基化驱动的差异表达基因的鉴定 A:研究技术路线图。主要包括候选DNA甲基化驱动的差异表达基因的发掘阶段、模型训练阶段和模型验证和评估阶段。B:在发掘队列中鉴定出的DNA甲基化驱动的差异表达基因数量。上图为鉴定出的“低甲基化-高表达”基因数量,下图为鉴定出“高甲基化-低表达”基因数量。C:在发掘队列和模型训练队列中DNA甲基化驱动的差异表达基因的热图。左图为基因DNA甲基化水平热图(平均甲基化水平),右图为基因表达热图(平均表达水平)。ICGC-LIRI-JP:国际癌症基因组联盟日本肝癌项目(international cancer genome consortium liver cancer-RIKEN of JP project);N:肝癌癌旁组织数量;T:肝癌组织数量;TCGA-LIHC:癌症基因组图谱-肝细胞癌项目(the cancer genome atlas-liver hepatocellular carcinoma);β:基因的DNA甲基化水平。 |
Fig. 1 Identification of the DNA methylation-driven differentially expressed genes in HCC |
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