DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值
Prognostic and predictive value of a DNA methylation-driven transcriptional signature in hepatocellular carcinoma
A：使用LASSO回归分析和10倍交叉验证构建预后预测评分模型。左图为基于最小原则(minimum criteria)采用10倍交叉验证对LASSO模型进行调参,通过LASSO回归交叉验证计算的部分似然偏差(partial likelihood deviance)被绘制为log(λ)的函数。y轴表示部分似然偏差,x轴表示log(λ),沿x轴上方的数字表示预测变量的平均数量,红点表示具有给定λ的每个模型的平均偏差值,穿过红点的竖线表示偏差的上限值和下限值,垂直虚线分别表示最小误差的λ值和最大λ值。右图为51个预后基因的LASSO系数分布,垂直虚线表示采用10倍交叉验证选取的基因数,当基因数为10时,部分似然偏差为最小值,对应最小λ值。B：基于LASSO系数和基因表达在模型训练队列建立预后模型。左图为模型训练队列中肝癌患者的风险评分及生存时间的散点图,中间图为模型训练队列中不同风险评分组(中位数分组)患者的生存曲线图,右图为采用ROC曲线分析评估预测模型对训练队列中患者生存率的预测性能。C：在模型验证队列中验证预后模型。左图为模型验证队列中肝癌患者的风险评分及生存时间的散点图,中间图为模型验证队列中不同风险评分组(中位数分组)患者的生存曲线图,右图为ROC曲线分析评估预测模型对验证队列中患者生存率的预测性能。由于验证队列1和3中患者达到5年生存的数量较少,所以并未对患者5年生存率进行ROC分析。卡方检验(χ2)用于评价组间患者生存分布差异;组间生存差异采用Log-rank方法进行比较;ROC分析用于评估模型预测性能。AUC：曲线下面积(area under curve);CI：置信区间(confidence interval);HR：风险比例(hazard ratios);LASSO：最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator);ROC：受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve)。
