CNGBdb：国家基因库生命大数据平台

陈凤珍, 游丽金, 杨帆, 王丽娜, 郭学芹, 高飞, 华聪, 谈聪, 方林, 单日强, 曾文君, 王博, 王韧, 徐讯, 魏晓锋

CNGBdb: China National GeneBank DataBase

Chen Fengzhen, You Lijin, Yang Fan, Wang Lina, Guo Xueqin, Gao Fei, Hua Cong, Tan Cong, Fang Lin, Shan Riqiang, Zeng Wenjun, Wang Bo, Wang Ren, Xu Xun, Wei Xiaofeng

表3 CNGBdb用户已创建的部分数据集

Table 3 Some datasets created by CNGBdb users

分类 数据集名称 简要介绍 网址 植物 10,000 Plant Genomes Project 万种植物基因组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/plant/DATApla1/ The 3000 Rice Genomes Project 3000水稻项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/plant/DATApla2/ 1000 Plant Transcriptomes 千种植物转录组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/plant/DATApla4/ Data of Ruili Botanical Garden 瑞丽珍稀植物园689种植物 基因组测序数据 https://db.cngb.org/datamart/plant/DATApla5/ 动物 The B10K Genomes Project 万种鸟基因组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/animal/DATAani1/ 1K Insect Transcriptome 千种昆虫转录组数据集 https://db.cngb.org/datamart/animal/DATAani3/ Transcriptomes of 1000 Fishes 千种鱼转录组数据集 https://db.cngb.org/datamart/animal/DATAani2/ Vertebrate Genomes 10K 万种脊椎动物数据集 https://db.cngb.org/datamart/animal/DATAani5/ Life Periodic Plan (LPP) 生命周期表项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/animal/DATAani6/ 微生物 1520 reference genomes 覆盖人体肠道中所有主要细菌门和 属的1520个基因组数据集 https://db.cngb.org/datamart/microbe/DATAmic1/ Earth Microbiome Project 地球微生物组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/microbe/DATAmic4/ 1000 Fungal Genomes Project 千种真菌基因组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/microbe/DATAmic7/ MetaHIT (metagenomics of humanintestinal tract) 欧盟的肠道微生物组计划数据集 https://db.cngb.org/datamart/microbe/DATAmic5/ Human Microbiome Project 人类微生物组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/microbe/DATAmic3/ 人群 WGS of 175 Mongolians 175个蒙古人基因组数据集 https://db.cngb.org/datamart/other/DATAoth1/ 1000 Genomes Project (human) 千人基因组项目数据集 https://db.cngb.org/datamart/other/DATAoth2/