牛、绵羊角的遗传定位及遗传机制研究进展

何晓红, 蒋琳, 浦亚斌, 赵倩君, 马月辉

Progress on genetic mapping and genetic mechanism of cattle and sheep horns

He Xiaohong, Jiang Lin, Pu Yabin, Zhao Qianjun, Ma Yuehui

表1 绵羊角性状相关遗传区间、SNPs和候选基因

Table 1 The genetic regions, SNPs and candidate genes associated with horn traits in sheep

表型或功能 遗传区间、候选基因或SNPs 数据类型 分析方法 物种或品种 野生或家养 参考文献 无角 Chr.10: OarHH41、AGLA226 微卫星标记 连锁分析 (美利奴羊×罗姆尼羊)×美利奴羊 家养 [40] Chr.10: 7.4 cM区间 微卫星和 等位酶标记 关联分析 索艾羊 野生 [44,48] Chr.10: 200 kb区间 SNPs 连锁分析 美利奴羊×罗姆尼羊 家养 [41] Chr.10:OAR10_29546872,RXFP2 DNA芯片、 重测序数据 选择信号分析、关联分析和选择性清扫分析 陶赛特羊、美利奴羊;小尾寒羊、湖羊 家养 [26,37] Chr.10:29.3~29.5 Mb,RXFP2、EEF1DP3 DNA芯片、 测序 连锁不平衡分析、芯片GWAS分析、多态性检测 澳洲美利奴羊、Navajo-Churro绵羊、滩羊、萨福克羊 家养 [24,42,52] RXFP2 3′UTR 1.8 kb片段插入 测序、分型 序列分析 7个瑞士绵羊品种 家养 [51] 角的多态性 Chr.10:RXFP2 DNA芯片;RXFP2基因型 GWAS分析、选择系数和平衡频率分析、基因型之间的适应度差异分析 索艾羊 野生 [49,50] 角的长度、 角的方向 Chr.10:CSRD87、OarSEJ09 Chr.10:RXFP2 微卫星标记 DNA芯片、 重测序 连锁图谱QTL定位、GWAS分析、选择性清扫分析 索艾羊、大角羊、 藏绵羊 野生、家养 [45,46,48~50,55] 角早期发育 (1) SOX9和HOXD; (2) SOX10、SNAI1、SNAI2、TFAP2A、NGFR和COL11A2 基因组测序、 转录组数据 基因组、转录组分析 有角反刍动物 野生和家养 [7] 畸形角 COL6A2、COL6A1、PARVA、TNN、TNC 蛋白质组学 数据 差异分析 阿勒泰羊 家养 [62] Chr.10：RXFP2 DNA芯片 GWAS分析 索艾羊 野生 [49] 多角表型 Chr.2: 128~135 Mb、HOXD基因簇、MTX2、EVX2、KIAA1715 DNA芯片、 重测序数据 GWAS分析、关联分析和品种间的选择性清扫分析 阿勒泰羊、蒙古羊、泗水裘皮羊、Jacobs羊、Navajo-Churro羊和Damara绵羊 家养 [9,22~24,26] 多角亚型 Chr.2:132.8 Mb,MTX2、HOXD基因簇 DNA芯片 芯片GWAS分析 多角藏绵羊 家养 [19]