基于全基因组数据的AI-SNPs筛选及大陆次级区域内群体遗传结构差异研究

王浩宇, 胡渝涵, 曹悦岩, 朱强, 黄雨果, 李茜, 张霁

AI-SNPs screening based on the whole genome data and research on genetic structure differences of subcontinent populations

Wang Haoyu, Hu Yuhan, Cao Yueyan, Zhu Qiang, Huang Yuguo, Li Xi, Zhang Ji

表1 数据集A中SNP的FST值分布情况

Table 1 The distribution of FST value of SNPs in dataset A

数据集 最大FST值 最小FST值 总位点数 FST≥0.25位点数 0.25>FST≥0.15位点数 0.15>FST≥0.05位点数 A1(JPT-CHB) 0.266925 0.095475 591 1 19 571 A2(JPT-CHS) 0.407479 0.111107 598 10 87 501 A3(JPT-CDX) 0.788409 0.16243 630 46 584 0 A4(JPT-KHV) 0.583637 0.141417 623 19 435 169 A5(CHB-CHS) 0.146048 0.05001 723 0 0 723 A6(CHB-CDX) 0.517659 0.109475 563 9 84 470 A7(CHB-KHV) 0.25611 0.087147 670 1 18 651 A8(CHS-CDX) 0.310909 0.081595 787 3 18 766 A9(CHS-KHV) 0.192399 0.069052 631 0 7 624 A10(CDX-KHV) 0.256551 0.067479 461 1 6 454