细菌最小基因组研究进展

李金玉, 杨姗, 崔玉军, 王涛, 滕越

Research progress of bacterial minimal genome

Jinyu Li, Shan Yang, Yujun Cui, Tao Wang, Yue Teng

表2 缩减基因组大肠杆菌及其特征

Table 2 Reduced genomes E. coli and its characteristics

原始菌株 缩减基因组菌株名称 原始基因组大小(Mb) 缩减量(%) 特征 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 CDΔ3456 4.64 313 kb (6.8) 生长速度正常 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 MDS12 4.64 376 kb (8.1) 生长速度正常,细菌生长密度提高10% Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 MDS42 4.64 708 kb (15.3) 生长速度正常,更高的转化效率 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 MS56 4.64 1068 kb (23.0) 生长速度正常,遗传稳定性提高 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 Δ16 4.64 1377 kb (29.7) 较低的生长速度,异常的拟核结构 Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 MGF-01 4.65 1030 kb (22.2) 细菌生长密度提高50%,更高的苏氨酸产量 Bacillus subtilis str. 168 Δ6 4.22 320 kb (7.7) 生长速度正常 Bacillus subtilis str. 168 PG10 4.22 1456 kb (34.5) 较低的生长速度 Bacillus subtilis str. 168 PG38 4.22 1535 kb (36.4) 较低的生长速度 Bacillus subtilis str. 168 MGB469 4.22 469 kb (11.1) 生长速度正常 Bacillus subtilis str. 168 MG1M 4.22 991 kb (23.5) 生长速度正常 Bacillus subtilis str. 168 MBG874 4.22 874 kb (20.7) 较低的生长速度,更高的蛋白产量 Streptomyces avermitilis SUKA17 9.03 1674 kb (18.5) 更高的抗生素产量 Schizosaccharomyces pombe A8 12.6 657 kb (5.2) 更高的蛋白产量