不同基因型毛白杨同源重组变异研究

耿喜宁, 芦特, 杜康, 杨珺, 康向阳

Variation of homologous recombination in Populus tomentosa with different genotypes

Xining Geng, Te Lu, Kang Du, Jun Yang, Xiangyang Kang

附表1(续) 鉴定hDNA的110对SSR引物信息

Supplemental Table 1(Continued) The information of 110 pairs of SSR primers applied for detection of hDNA

标记名称 染色 体 位置 (Mb) 重复 单元 引物序列(5?→3?) Tm (℃) GC含 量(%) 3532中的 等位基因(bp) 3119中的 等位基因(bp) YX1中的 等位基因(bp) 标记名称 染色 体 位置 (Mb) 重复 单元 引物序列(5?→3?) Tm (℃) GC含 量(%) 3532中的 等位基因(bp) 3119中的 等位基因(bp) YX1中的 等位基因(bp) GCPM_1857-1 2 3.205 tat F: TGCCAGGGTAAGAAATAAAA 49.25 35.00 196/212 196/212 196/200 R: GAACTGAACTGATCTTGTTGC 53.66 42.86 ORPM_222 2 5.481 ag F: TGCGAACATTTTTCTTGTGG 51.30 40.00 201/205 201/205 205 R: CGCAATAGAGCCTTTGGATG 55.40 50.00 GCPM_2637 2 11.126 tta F: GACACCGTTTCTTTTCTGAG 53.35 45.00 213/216 213/216 217 R: ACCAGATCTTCATCTTCCAA 51.30 40.00 PMGC_2709 2 12.013 ga F: ATTGTAATTATTGAACACATGCC 50.64 30.43 234/236 234/236 200/214 R: GTGCAGTTCAGAGTATTGTTG 53.66 42.86 ORPM_161 2 13.406 ta F: CGGGCTAGCTCAATTAGGAG 57.45 55.00 205/219 205/219 205/207 R: ATCACCGCGAGATTCTTGTC 55.40 50.00 ORPM_459 2 14.121 att F: TTGTGGCTGTGACCAGAAAG 55.40 50.00 227/230 227/230 233/246 R: CGAGCCTCAGAAAATTGCTT 53.35 45.00 GCPM_2768 2 20.942 ga F: TTATTTGGATCCTGAAATGG 49.25 35.00 196/206 186/206 168/200 R: GATGGTTCGGTATGTGAGTT 53.35 45.00 PTSSR2445 2 23.932 ag F: CTTTGATCCCACCAACCCCA 57.45 55.00 230/244 230/244 240/242 R: TAGGCAGCTCTTTGACTGCA 55.40 50.00 PTSSR774 2 24.833 tga F: TAAGGGCAAACATGGGAGGG 57.45 55.00 239/242 239/242 236/239 R: TAGGCAGAAGTAGCAGCAGC 57.45 55.00 GCPM_2840-1 3 2.708 ta F: GAATCCAAAACAAAACATCC 49.25 35.00 227/231 227/231 225/231 R: AGGCATCAAAACTAATTGGA 49.25 35.00 GCPM_134-1 3 2.708 ta F: AGGCATCAAAACTAATTGGA 49.25 35.00 227/230 227/230 225/231 R: GAATCCAAAACAAAACATCC 49.25 35.00 GCPM_2628-1 3 4.469 agc F: TAGGCCATGTTTTTGCTTAT 49.25 35.00 211/214 211/214 211 R: GTGCCTCATTTATTGGTAGG 53.35 45.00 ORPM_230 3 9.739 ga F: CTTCCCACCCCCAACATAAC 57.45 55.00 213/219 213/219 211/215 R: TGTCATTCCACAGAGAGTCTGG 57.67 50.00 GCPM_1184-1 3 14.831 ct F: TCTTGGCGAGAGAAGTAGAG 55.40 50.00 156/158 156/158 154/164 R: GGATTTGGTGAAAATTGAAG 49.25 35.00 GCPM_768-1 3 16.826 cac F: ATTCGCTTCTTCTTCCTCTT 51.30 40.00 208/211 208/211 211 R: TATGAATTCCTCGTTGAACC 51.30 40.00 GCPM_2434-2 3 17.172 tct F: AGAGAGAGAGGTATGAGGGC 57.45 55.00 221/224 221/224 221 R: GTTCGGTAAAGGTGATGGA 53.01 47.37 GCPM_1468-2 3 17.480 gac F: CAAGTCATGGCTTCTCAAAC 53.35 45.00 192/195 192/195 195/198 R: CTATTGATCCTTGAAGACGC 53.35 45.00 GCPM_3465 3 20.996 gt F: TCAATGATTGGTCTTGTTGA 49.25 35.00 128/134 128/134 134/146 R: CAGAATTCAGAATAGAACCCA 51.71 38.10 GCPM_2625-1 4 0.188 gt F: GATTTCTATTGTGGCAAAGG 51.30 40.00 187/193 187/193 187 R: TGTATTCCTCCACTCCACTC 55.40 50.00