溶藻弧菌群体基因组学研究

郑宏源, 闫琳, 杨超, 武雅蓉, 秦婧靓, 郝彤宇, 杨大进, 郭云昌, 裴晓燕, 赵彤言, 崔玉军

Population genomics study of Vibrio alginolyticus

Zheng Hongyuan, Yan Lin, Yang Chao, Wu Yarong, Qin Jingliang, Hao Tongyu, Yang Dajin, Guo Yunchang, Pei Xiaoyan, Zhao Tongyan, Cui Yujun

图2 溶藻弧菌系统发育树与种群结构 A：181株菌基于核心基因组SNP构建的系统发育树。黑色、红色树枝分别代表谱系1和谱系2,树枝顶部紫色圆点代表鉴定到的12个克隆群(clonal groups, CGs),右下角红色虚线框代表的是发生跨洋传播的两株菌,内环代表不同的采样地点,外环代表不同采样来源。B：129株代表菌株基于fineSTRUCTURE软件的种群鉴定结果。列代表供体菌株(donor),行代表受体菌株(recipient),方格颜色表示供体向受体导入的序列片段数量,黑色线代表种群间的界线。

Fig. 2 Phylogenic tree and population structure of V. alginolyticus