| 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 2011 | 18 | 二代测序 | 迭代组装+从头组装 | [33] |
| 野生大豆(Glycine soja) | 2014 | 7 | 二代测序 | 从头组装 | [17] |
| 甘蓝(Brassica oleracea) | 2016 | 9 | 二代测序 | 迭代组装 | [22] |
| 苜蓿(Medicago truncatula) | 2017 | 15 | 二代测序 | 从头组装 | [76] |
| 二穗短柄草(Brachypodium distachyon) | 2017 | 54 | 二代测序 | 从头组装 | [16] |
| 水稻(Oryza sativa) | 2018 | 3010 | 二代测序+三代测序 | 比对组装 | [21] |
| 野生及栽培水稻(O. rufipogon, O. sativa) | 2018 | 66 | 二代测序 | 比对组装 | [42] |
| 水稻属及亲缘物种(Oryza, Leersia) | 2018 | 13 | 三代测序+二代测序 | 从头组装 | [18] |
| 辣椒属(Capsicum) | 2018 | 168 | 二代测序 | 比对组装 | [77] |
| 芝麻(Sesamum indicum) | 2018 | 5 | 二代测序 | 比对组装 | [78] |
| 番茄及野生亲缘种(Solanum section Lycopersicon) | 2019 | 725 | 二代测序 | 比对组装 | [19] |
| 向日葵(Helianthus annuus) | 2019 | 287 | 二代测序 | 比对组装 | [20] |
| 油菜(Brassica napus) | 2020 | 8 | 三代测序 | 从头组装 | [43] |
| 野生及栽培大豆(Glycine subgenus Soja) | 2020 | 29 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [39] |
| 大麦(Hordeum vulgare) | 2020 | 20 | 二代测序+三代测序 | 从头组装 | [79] |
| 番茄及野生亲缘种(Solanum section Lycopersicon) | 2020 | 14 | 二代测序+三代测序 | 比对组装(泛结构变异) | [45] |
| 鹰嘴豆(Cicer arietinum) | 2021 | 3366 | 二代测序 | 比对组装 | [80] |
| 棉花及亲缘种(Gossypium) | 2021 | 1961 | 二代测序 | 比对组装 | [81] |
| 野生及栽培高粱(Sorghum bicolor) | 2021 | 13 | 三代测序 | 从头组装 | [82] |
| 玉米(Zea may) | 2021 | 26 | 三代测序 | 从头组装 | [83] |
| 水稻(O. sativa) | 2021 | 33 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [34] |
| 野生及栽培萝卜(Raphanus) | 2021 | 11 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [84] |
| 黄瓜 (Cucumis sativus) | 2022 | 12 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [38] |
| 水稻属(Oryza) | 2022 | 251 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [85] |
| 棉花属(Gossypium) | 2022 | 10 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [86] |
| 多年生大豆(Glycine subgenus Glycine) | 2022 | 6 | 三代测序 | 从头组装 | [62] |
| 野生及栽培马铃薯(Solanum section Petota) | 2022 | 44 | 三代测序 | 从头组装 | [87] |
| 番茄(Solanum lycopersicum) | 2022 | 32 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [35] |
| 野生及栽培谷子(Setaria) | 2023 | 110 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [40] |
| 茶(Camellia sinensis) | 2023 | 22 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [41] |
| 柑橘属(Citrus) | 2023 | 12 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [36] |
| 番茄及野生亲缘种(Solanum section Lycopersicon) | 2023 | 13 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [85] |
| 玉米(Z. mays) | 2023 | 12 | 三代测序 | 从头组装 | [88] |
| 野生及栽培黍(Panicum miliaceum) | 2023 | 32 | 三代测序 | 从头组装+图基因组 | [46] |