一种新的基于单碱基延伸的SNP芯片技术

doi:10.3724/SP.J.1005.2009.00439

遗传 ›› 2009, Vol. 31 ›› Issue (4): 439-444.doi: 10.3724/SP.J.1005.2009.00439

一种新的基于单碱基延伸的SNP芯片技术

董园园^{1, 2};盛海辉¹;杨茜¹;曾娴婷¹;武雪梅¹;张春秀¹; 陈光²;肖华胜¹

1. 生物芯片上海国家工程研究中心, 上海201203;
2. 吉林农业大学生命科学学院, 长春130118

收稿日期:2008-10-21 修回日期:2008-10-30 出版日期:2009-04-10 发布日期:2009-04-10
通讯作者: 肖华胜

A new SNP microarray technology based on single base extension

DONG Yuan-Yuan^{1, 2};SHENG Hai-Hui¹;YANG Qian¹;ZENG Xian-Ting¹;WU Xue-Mei¹;ZHANG Chun-Xiu¹;CHEN Guang²;XIAO Hua-Sheng¹

1. National Engineering Center for Biochip at Shanghai, Shanghai 201203, China;
2. College of Life Science, Jilin Agriculture University, Changchun 130118, China

Received:2008-10-21 Revised:2008-10-30 Online:2009-04-10 Published:2009-04-10
Contact: XIAO Hua-Sheng

摘要/Abstract

摘要： 单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)是人类基因组中最常见的一种变异, 与疾病易感性、药物代谢等有着密切的关系。已经建立了多种SNP检测技术并得到了应用。单碱基延伸(Single base extension, SBE)是常用的SNP分型技术之一。文章建立了SBE结合Zip-code芯片技术对SNP进行分型, 为个体化用药及临床诊断芯片的研究与开发提供技术和方法。

关键词: 基因芯片, 基因分型, 单碱基延伸, 单核苷酸多态性

Abstract:

Single nucleotide polymorphism (SNP), which is one of the common variations in the human genome, plays important roles in disease susceptibility and drug metabolism. Several genotyping methods have been established and ap-plied in SNP study. Single base extension (SBE) is one of SNP genotyping technologies. In this study, we reported a SNP detection method, which combined SBE and Zip-code microarray technologies. The results will provide a tool for develop-ing products that can be used for personal medicine and clinical diagnosis.

董园园，盛海辉，杨茜，曾娴婷，武雪梅，张春秀，陈光，肖华胜 . 一种新的基于单碱基延伸的SNP芯片技术[J]. 遗传, 2009, 31(4): 439-444.

DONG Yuan-Yuan, SHENG Hai-Hui, YANG Qian, ZENG Xian-Ting, WU Xue-Mei, ZHANG Chun-Xiu, CHEN Guang, XIAO Hua-Sheng. A new SNP microarray technology based on single base extension[J]. HEREDITAS, 2009, 31(4): 439-444.

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A new SNP microarray technology based on single base extension

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